MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ramlibacter tataouinensis TTB310 chromosome

Total Repeats: 113326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015677	TGA	2	6	53	58	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337277608
2	NC_015677	AGC	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277608
3	NC_015677	GCCG	2	8	274	281	0 %	0 %	50 %	50 %	337277608
4	NC_015677	CTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277608
5	NC_015677	GCTC	2	8	336	343	0 %	25 %	25 %	50 %	337277608
6	NC_015677	GCC	2	6	382	387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277608
7	NC_015677	CGG	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277608
8	NC_015677	GCCG	2	8	405	412	0 %	0 %	50 %	50 %	337277608
9	NC_015677	CGA	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277608
10	NC_015677	CCGGC	2	10	428	437	0 %	0 %	40 %	60 %	337277608
11	NC_015677	CGG	2	6	573	578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277608
12	NC_015677	CAA	2	6	618	623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277608
13	NC_015677	GCT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277608
14	NC_015677	CGA	2	6	717	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277608
15	NC_015677	CTG	2	6	751	756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277608
16	NC_015677	CGA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277608
17	NC_015677	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337277608
18	NC_015677	CAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277608
19	NC_015677	AGG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277608
20	NC_015677	TTC	2	6	808	813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337277608
21	NC_015677	CTG	2	6	829	834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277608
22	NC_015677	AAG	2	6	838	843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337277608
23	NC_015677	TGA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337277608
24	NC_015677	GCC	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277608
25	NC_015677	CAA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277608
26	NC_015677	CTT	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337277608
27	NC_015677	GC	3	6	1073	1078	0 %	0 %	50 %	50 %	337277608
28	NC_015677	GAAG	2	8	1113	1120	50 %	0 %	50 %	0 %	337277608
29	NC_015677	GC	3	6	1135	1140	0 %	0 %	50 %	50 %	337277608
30	NC_015677	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277608
31	NC_015677	AGA	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337277608
32	NC_015677	ACT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277608
33	NC_015677	AAG	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337277608
34	NC_015677	CGGC	2	8	1255	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	337277608
35	NC_015677	CGG	2	6	1347	1352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277608
36	NC_015677	ACCAC	2	10	1358	1367	40 %	0 %	0 %	60 %	337277608
37	NC_015677	TGC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277608
38	NC_015677	GGC	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277609
39	NC_015677	ACC	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277609
40	NC_015677	CAC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277609
41	NC_015677	CAC	3	9	1701	1709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277609
42	NC_015677	GCCG	2	8	1749	1756	0 %	0 %	50 %	50 %	337277609
43	NC_015677	GGC	2	6	1804	1809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277609
44	NC_015677	GCCG	2	8	1836	1843	0 %	0 %	50 %	50 %	337277609
45	NC_015677	AGG	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277609
46	NC_015677	CCT	2	6	1871	1876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337277609
47	NC_015677	GCT	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277609
48	NC_015677	CTA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277609
49	NC_015677	AGC	2	6	2000	2005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277609
50	NC_015677	TGG	2	6	2012	2017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277609
51	NC_015677	AGG	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277609
52	NC_015677	CTG	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277609
53	NC_015677	CGG	2	6	2187	2192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277609
54	NC_015677	TGG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277609
55	NC_015677	CG	3	6	2284	2289	0 %	0 %	50 %	50 %	337277609
56	NC_015677	GCT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277609
57	NC_015677	CAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277609
58	NC_015677	CGA	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277609
59	NC_015677	CGG	2	6	2436	2441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277609
60	NC_015677	CAT	2	6	2445	2450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277609
61	NC_015677	ACCT	2	8	2470	2477	25 %	25 %	0 %	50 %	337277609
62	NC_015677	GTG	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277609
63	NC_015677	ACA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277610
64	NC_015677	CGG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
65	NC_015677	CAC	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277610
66	NC_015677	GGT	2	6	2852	2857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277610
67	NC_015677	CGA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
68	NC_015677	GGCC	2	8	2882	2889	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
69	NC_015677	CGA	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
70	NC_015677	TCG	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
71	NC_015677	GTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277610
72	NC_015677	GAC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
73	NC_015677	GCC	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
74	NC_015677	CGG	2	6	3038	3043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
75	NC_015677	GGC	2	6	3075	3080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
76	NC_015677	GGCGTG	2	12	3087	3098	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	337277610
77	NC_015677	TGC	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
78	NC_015677	GCG	2	6	3140	3145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
79	NC_015677	CGC	2	6	3194	3199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
80	NC_015677	GCG	3	9	3211	3219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
81	NC_015677	AAC	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277610
82	NC_015677	AAC	2	6	3366	3371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277610
83	NC_015677	GCT	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
84	NC_015677	CGA	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
85	NC_015677	CGG	2	6	3431	3436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
86	NC_015677	TCG	2	6	3448	3453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
87	NC_015677	TCA	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277610
88	NC_015677	GTGCT	2	10	3585	3594	0 %	40 %	40 %	20 %	337277610
89	NC_015677	CAA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277610
90	NC_015677	CGG	2	6	3620	3625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
91	NC_015677	GC	3	6	3644	3649	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
92	NC_015677	CAA	2	6	3668	3673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277610
93	NC_015677	AAG	2	6	3699	3704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337277610
94	NC_015677	CGA	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
95	NC_015677	CCAG	2	8	3787	3794	25 %	0 %	25 %	50 %	337277610
96	NC_015677	GTG	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277610
97	NC_015677	ACG	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
98	NC_015677	ATC	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277610
99	NC_015677	ATC	2	6	3912	3917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277610
100	NC_015677	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
101	NC_015677	GC	4	8	3924	3931	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
102	NC_015677	CG	3	6	3941	3946	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
103	NC_015677	GC	3	6	3951	3956	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
104	NC_015677	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
105	NC_015677	TCG	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
106	NC_015677	CCG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
107	NC_015677	GC	3	6	4155	4160	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
108	NC_015677	GCT	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
109	NC_015677	CGA	2	6	4265	4270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
110	NC_015677	ACC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277610
111	NC_015677	CAT	4	12	4301	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277610
112	NC_015677	CTG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
113	NC_015677	CTT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337277610
114	NC_015677	TGG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277610
115	NC_015677	GCC	2	6	4418	4423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
116	NC_015677	AGG	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277610
117	NC_015677	TGC	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
118	NC_015677	CGT	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
119	NC_015677	CGG	2	6	4555	4560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
120	NC_015677	GC	3	6	4596	4601	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
121	NC_015677	GC	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	337277610
122	NC_015677	CAG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
123	NC_015677	CGC	2	6	4775	4780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
124	NC_015677	GCC	2	6	4840	4845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
125	NC_015677	GGC	2	6	4922	4927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
126	NC_015677	CTG	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
127	NC_015677	GGCGAG	2	12	4974	4985	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	337277610
128	NC_015677	AGG	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277610
129	NC_015677	GCTG	2	8	5029	5036	0 %	25 %	50 %	25 %	337277610
130	NC_015677	GCCGAG	2	12	5040	5051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	337277610
131	NC_015677	AGC	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
132	NC_015677	ACC	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277610
133	NC_015677	GCC	2	6	5137	5142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277610
134	NC_015677	TGC	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277610
135	NC_015677	CGA	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277610
136	NC_015677	GCG	2	6	5253	5258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277610
137	NC_015677	TG	3	6	5267	5272	0 %	50 %	50 %	0 %	337277610
138	NC_015677	GCG	2	6	5665	5670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277611
139	NC_015677	CGC	2	6	5677	5682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277611
140	NC_015677	GCT	2	6	5731	5736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277611
141	NC_015677	GGA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277611
142	NC_015677	GCC	2	6	5858	5863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277611
143	NC_015677	CGT	2	6	5978	5983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277611
144	NC_015677	CGC	2	6	6090	6095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277611
145	NC_015677	CGC	2	6	6112	6117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277611
146	NC_015677	GAAG	2	8	6136	6143	50 %	0 %	50 %	0 %	337277611
147	NC_015677	ATG	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337277612
148	NC_015677	AC	3	6	6266	6271	50 %	0 %	0 %	50 %	337277612
149	NC_015677	GGC	2	6	6285	6290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277612
150	NC_015677	ACG	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277612
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152	NC_015677	CAC	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337277612
153	NC_015677	GGA	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277612
154	NC_015677	TCGGCA	2	12	6461	6472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337277612
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156	NC_015677	CG	3	6	6495	6500	0 %	0 %	50 %	50 %	337277612
157	NC_015677	CGA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277612
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163	NC_015677	CGT	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277612
164	NC_015677	TCG	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277612
165	NC_015677	GCA	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277612
166	NC_015677	ACG	2	6	6977	6982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277612
167	NC_015677	CGG	2	6	7071	7076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277612
168	NC_015677	ACG	2	6	7115	7120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277612
169	NC_015677	TGTT	2	8	7121	7128	0 %	75 %	25 %	0 %	337277612
170	NC_015677	GTG	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277612
171	NC_015677	ATC	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277612
172	NC_015677	GCGTG	2	10	7299	7308	0 %	20 %	60 %	20 %	337277612
173	NC_015677	CTTTT	2	10	7468	7477	0 %	80 %	0 %	20 %	337277612
174	NC_015677	TAC	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277612
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176	NC_015677	GAG	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277612
177	NC_015677	GGCGAT	2	12	7714	7725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	337277612
178	NC_015677	GAG	2	6	7742	7747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277613
179	NC_015677	GAC	2	6	7799	7804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277613
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190	NC_015677	ACGC	2	8	8135	8142	25 %	0 %	25 %	50 %	337277613
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241	NC_015677	GAAG	2	8	12674	12681	50 %	0 %	50 %	0 %	337277615
242	NC_015677	AAC	2	6	12793	12798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337277615
243	NC_015677	TAC	2	6	12844	12849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277615
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245	NC_015677	CAGA	2	8	12927	12934	50 %	0 %	25 %	25 %	337277615
246	NC_015677	TCG	2	6	12935	12940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277615
247	NC_015677	GTG	2	6	12978	12983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337277615
248	NC_015677	AGG	2	6	13048	13053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277615
249	NC_015677	GCC	2	6	13079	13084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277615
250	NC_015677	AGTCTG	2	12	13102	13113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337277615
251	NC_015677	GCG	2	6	13163	13168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277615
252	NC_015677	GAA	2	6	13179	13184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337277615
253	NC_015677	CTG	2	6	13218	13223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277615
254	NC_015677	CGG	2	6	13233	13238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277615
255	NC_015677	C	6	6	13241	13246	0 %	0 %	0 %	100 %	337277615
256	NC_015677	GAG	2	6	13300	13305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277615
257	NC_015677	CTGG	2	8	13535	13542	0 %	25 %	50 %	25 %	337277615
258	NC_015677	GAG	2	6	13548	13553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337277615
259	NC_015677	AT	3	6	13569	13574	50 %	50 %	0 %	0 %	337277615
260	NC_015677	TTA	2	6	13581	13586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337277615
261	NC_015677	CAAA	2	8	13595	13602	75 %	0 %	0 %	25 %	337277615
262	NC_015677	TAC	2	6	13609	13614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277615
263	NC_015677	CCG	2	6	13636	13641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337277615
264	NC_015677	CT	3	6	13665	13670	0 %	50 %	0 %	50 %	337277615
265	NC_015677	A	7	7	13674	13680	100 %	0 %	0 %	0 %	337277615
266	NC_015677	CGA	2	6	13834	13839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277615
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268	NC_015677	CGATC	2	10	13853	13862	20 %	20 %	20 %	40 %	337277615
269	NC_015677	CT	3	6	13930	13935	0 %	50 %	0 %	50 %	337277615
270	NC_015677	CACT	2	8	13969	13976	25 %	25 %	0 %	50 %	337277615
271	NC_015677	ACT	2	6	14096	14101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337277615
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392	NC_015677	TTC	3	9	20139	20147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337277618
393	NC_015677	CCT	2	6	20151	20156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337277618
394	NC_015677	GCG	2	6	20157	20162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337277618
395	NC_015677	GAC	2	6	20163	20168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337277618
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500	NC_015677	TGC	2	6	24595	24600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337277623

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